Câu chuyện được bắt đầu với tin một con tàu lạ chìm ngoài khơi vùng biển Bécmuđa. Vào kì nghỉ hè, nhóm bạn Nôbita bàn nhau xem đi lên núi hay xuống biển, Đôrêmon quyết định xuống biển và leo núi cùng một lúc bằng cách... xuống đáy biển. Xêkô, Chaien muốn an toàn còn Xuka không thể đi riêng với Nôbita được nên chỉ có Đôrêmon và Nôbita cùng đi với chiếc xe Baky.
Câu chuyện về chú thỏ con chưa hiểu đời có cuộc chiến đấu chống lại những thế lực mạnh mẽ. Từ đây cậu rút ra nhiều bài học trong cuộc sống....
Nôbita muốn giấu mẹ tập bài điểm 0 của mình và Đôrêmon đã giúp cậu ta đưa chúng xuống lòng đất. Cùng với bạn bè của mình, Nôbita chơi vui vẻ trong thế giới ấy. Không may, Xêkô mất tích và qua đó nhóm Đôrêmon đã phát hiện cả một thế giới dưới lòng đất – một thế giới hoang sơ như ở thời đại khủng long. Họ gặp những người Xatênô Nicôsan vốn do một loài kỳ nhông tiến hóa thành và chơi đùa dưới ấy.
trong một thế giới của con người và thế giới của ma quỷ (youkai) đã chồng chéo nhau, để lại con người bước đi trên đường phố của cuộc sống như họ bình thường, trong khi quỷ đi, không thấy được bằng mắt thường, xuống các đường phố rất giống nhau.
Tên ác quỷ Maltazard với mưu đồ biến thành người thật, giờ đây đang tạo một đạo quân khủng khiếp nhằm thống trị thế giới. Hắn lừa Arthur vào thế giới của người tí hon. Để ngăn chặn âm mưu của Maltazard, Arthur phải nhờ đến sự giúp đỡ của những người bạn Selenia, Betameche. Arthuer buộc phải trở lại hình dáng con người trước khi quá muộn.